玛雅文明的消失之谜外界的说法有很多，其中最为贴近实际的就是穷兵黩武导致生态崩溃。考古学家们经过破译了大量文字，发现玛雅人并不是像我们以前认为的，是一群非常爱好和平而且具有丰富知识的人。很多证据证明其实玛雅人其实是一个穷兵黩武的民族。
例如，在蒂卡尔曾发现一些类似护城河和胸墙的长而且狭窄的壕沟和土埂。这种曾用于防御的城墙也在拜肯发现过。人们在卡拉科尔的建筑物上发现有烧焦的痕迹，还发现一个未被埋葬的儿童躺在一个金字塔的地板上。在伯南帕克曾发现过许多栩栩如生的类似宗教仪式的壁画，而现在我们再看它们，则仿佛是那些真实的战争场面的再现。而一个崇尚武力的国家注定了它的民生经济不会高到哪里去，最具代表性的应该就是苏联了。
玛雅文明虽然是城市文明，却建立在玉米农业的根基之上，这就是穷兵黩武国家最有代表的表现。自古以来，玛雅农民采用一种极原始的耕作法：他们先把树木统统砍光，过一段时间干燥以后，在雨季到来之前放火焚毁，以草木灰作肥料，覆盖住贫瘠的雨林土壤。烧一次种一茬，其后要休耕1－3年，有的地方甚至要长达6年，待草木长得比较茂盛之后再烧再种。当古典期文明繁盛、人口大增时，农业的压力越来越大，人们更多地毁林开荒，同时把休耕时间尽量缩短，然而这样一来，土壤肥力下降，玉米产量越来越少。玛雅文明在人口大发展之后，面临着生态环境恶化、生活资源枯竭的严重问题，社会状况一落千丈。
更为严重的是，在神权政治的体制下，玛雅王族和祭司将这种种“衰败之象”都归结为神的不满。他们更多地建神庙，更频繁、更隆重地祈祷，期盼能借神力扭转乾坤。当然，这样做的结果是浪费了更多的人力和已十分贫乏的资源，直至陷入不可救药的恶性循环。随着农业生产供应的严重匮乏，玛雅古典期高度发达的文明也开始崩溃。当城市周围贫瘠的荒地连成一片，饥饿就迫使玛雅人弃城而去了。经过百年衰败动荡之后，中央低地各城邦都湮没在热带丛莽之中，绿色植物悄悄覆盖起一切，像掩藏起一个久远的秘密。