孔子的后裔只是有一支去了台湾，还有一只留在了大陆，不过大陆的这支因为时政原因迅速的败落而不为人之而已。这种两边下注的行为也十分符合大家族的做法，毕竟无论哪方胜利了对孔家人都影响不大。而孔家的分支能跟蒋介石去台湾与孔家的历史有关。
孔子嫡长孙自汉朝开始便被历朝历代的皇帝封官或封衍圣公，一般都是专管祭孔之事，民国时期国民政府封孔子第七十七代嫡长孙孔德成为“大成至圣先师奉祀官”，既然是国民政府的官员跟着政府迁至台湾是理所应当之事。而且台湾官方至今仍坚持每年的祭孔仪式，从未间断。
两岸破冰后，孔德成还担任了山东曲阜师范学校名誉院长和山东曲阜孔子研究院永久荣誉院长。在台湾，孔德成继续享受世袭特任官的待遇，月薪约3~4万人民币。他的唯一工作，便是每年在9月28日孔子诞辰纪念日，负责参加台北孔庙的祭典。目前在台湾地区大概还有3000多位孔子后人。