之所以很多人认为博士是黑衣组织的老大，主要是因为苦艾酒和灰原的一段对话。灰原哀是吃了缩小毒药变成七八岁样子的宫野志保，到了快ending的时候，她冲着苦艾酒大声喊求证，是否阿笠博士就是黑衣组织的boss。苦艾酒缓缓的说出一连串话语，好像在证实阿笠博士的身份。

首先，阿笠博士确实没有什么稳定收入，这一点作为寄养在阿笠博士家的灰原哀是再清楚不过了。灰原哀听着乌丸平静的叙述，仿佛日常聊天一样，她的眉头慢慢的皱起来，眼睛也闭上了，她不敢相信，平易近人，对他们疼爱有加的阿笠博士居然是黑衣组织的老大。可是越听，越觉得乌丸说的在理，阿笠博士确实是没有正经职业和固定收入，而且发明也没有多少有用的，但是他却三天两头的带着少年侦探团的孩子们出门玩，这确实不符合常理。

除此之外阿笠这两个字，如果拆解成阿竹立用日文反过来拼写就是拉丁文里面的莫里亚帝。所以阿笠博士其实应该叫莫里亚帝教授——福尔摩斯里的罪恶的教授。不过这只是网友们的猜测而已，阿笠博士不可能是黑衣组织的boss啦，毕竟如果阿笠博士真的是幕后boss的话柯南开始就是结束了。